3月22日,重点实验室李子杰团队在Chemical Engineering Journal(IF:13.2)发表题为《High-efficiency production of lacto-N-triose II through combinatorial metabolic strategies in Saccharomyces cerevisiae》的研究论文。该研究基于组合代谢策略,在酿酒酵母中构建乳糖-N-三糖II(LNT II)高效合成体系,摇瓶产量达1.2 g/L,5 L发酵罐产量18.1 g/L,为目前酵母合成LNT II最高报道水平。以下为全文整理解读。
一、LNT II合成底盘菌株的构建
以酿酒酵母CEN.PK2-1C为出发菌株,搭建完整LNT II合成通路:
1.整合乳酸转运蛋白基因LAC12,赋予酵母乳糖摄取能力;
2.筛选高活性β-1,3-N-乙酰葡糖胺转移酶lgtA-1,实现LNT II合成;
3.优化LAC12与lgtA-1拷贝数,确定2拷贝LAC12+1拷贝lgtA-1为最优组合,初始菌株YS05摇瓶产量0.151 g/L。
二、限速酶Gfa1p鉴定与定向进化
明确Gfa1p为LNT II合成限速酶,受磷酸化与UDP-GlcNAc反馈双重调控:
1.定点突变关键位点(Arg196、Lys197、Ser199),构建Gfa1p突变文库;
2.开发乳糖响应型抑制筛选平台,结合流式细胞分选(FACS)高通量筛选;
3.获得最优突变体Gfa1pᴿ¹⁹⁶ᴷ-ᴷ¹⁹⁷ᴴ,菌株YS14产量提升至0.389 g/L,为初始菌株的2.57倍。
三、三大乳糖响应生物传感器开发
基于酵母内源GAL调控系统,构建3种适配不同场景的乳糖传感器:
1.LacGAL v1:响应范围宽(0–2 g/L),适合高通量筛选;
2.LacGAL v2:删除GAL1阻断半乳糖代谢,灵敏度高、诱导强度大;
3.LacGAL v3:敲除MIG1解除葡萄糖抑制,可在葡萄糖培养基中响应乳糖。
四、己糖胺通路强化与辅因子供给优化
强化前体UDP-GlcNAc供给,系统过表达通路关键基因:
1.过表达GNA1、PCM1、QRI1,提升己糖胺通路通量;
2.强化乙酰辅酶A与UTP供给,共表达ALD6、ADH2;
3.组合优化后菌株YS33摇瓶产量达0.644 g/L。
五、CRISPRi精准下调竞争通路
采用dCas9-Mig1介导的CRISPRi系统,精准抑制竞争代谢支路:
1.下调糖酵解:PFK1、PFK2、PFK26、PFK27;
2.下调磷酸戊糖途径:ZWF1;
3.下调己糖代谢:PGM1、PGM2、PMI40;
4.多靶点组合抑制,菌株YS34摇瓶产量突破1.2 g/L。
六、5 L发酵罐分批补料发酵验证
最优菌株YS34在5 L发酵罐中表现:
1.发酵120 h,LNT II产量18.1 g/L;
2.乳糖转化率0.71 mol/mol,生产强度0.15 g/L/h;
3.连续传代12代产量稳定,具备工业化应用潜力。
该研究建立“通路搭建+酶定向进化+生物传感器筛选+CRISPRi全局调控”的一体化策略,首次在酿酒酵母中实现LNT II高效合成,为母乳低聚糖(HMOs)真核生物制造提供全新技术方案。
